Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NRDE2Q9H7Z3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NRDE2Q9H7Z3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms