Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7T0

CATSPERB, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERBQ9H7T0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CATSPERBQ9H7T0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CATSPERBQ9H7T0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPERBQ9H7T0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPERBQ9H7T0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPERBQ9H7T0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPERBQ9H7T0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPERBQ9H7T0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CATSPERBQ9H7T0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms