Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RPAP3Q9H6T3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPAP3Q9H6T3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms