Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNMDQ9H2S6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNMDQ9H2S6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms