Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIOBPQ9H2D6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIOBPQ9H2D6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms