Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
INO80BQ9C086 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
INO80BQ9C086 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms