Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NLRP1Q9C000 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NLRP1Q9C000 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms