Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EDEM3Q9BZQ6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDEM3Q9BZQ6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms