Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A5Q9BY07 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms