Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ3

C1QTNF4, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF4Q9BXJ3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1QTNF4Q9BXJ3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms