Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM14BQ9BX40 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM14BQ9BX40 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms