Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GATA5Q9BWX5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GATA5Q9BWX5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms