Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIOK2Q9BVS4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms