Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAMP8Q9BV40 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VAMP8Q9BV40 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAMP8Q9BV40 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms