Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RSG1Q9BU20 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RSG1Q9BU20 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms