Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MTA3Q9BTC8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MTA3Q9BTC8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms