Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT17Q9BSW7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT17Q9BSW7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms