Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP6Q9BRS8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP6Q9BRS8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP6Q9BRS8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP6Q9BRS8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP6Q9BRS8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP6Q9BRS8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP6Q9BRS8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP6Q9BRS8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP6Q9BRS8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP6Q9BRS8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP6Q9BRS8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP6Q9BRS8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP6Q9BRS8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP6Q9BRS8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms