Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAAF1Q9BRP4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAAF1Q9BRP4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAAF1Q9BRP4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAAF1Q9BRP4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAAF1Q9BRP4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAAF1Q9BRP4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAAF1Q9BRP4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAAF1Q9BRP4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAAF1Q9BRP4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAAF1Q9BRP4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PAAF1Q9BRP4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAAF1Q9BRP4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAAF1Q9BRP4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAAF1Q9BRP4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms