Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
FYCO1Q9BQS8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
FYCO1Q9BQS8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms