Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSRNP1Q96S65 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms