Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUDCD1Q96RS6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUDCD1Q96RS6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUDCD1Q96RS6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUDCD1Q96RS6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUDCD1Q96RS6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUDCD1Q96RS6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUDCD1Q96RS6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUDCD1Q96RS6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUDCD1Q96RS6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUDCD1Q96RS6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUDCD1Q96RS6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms