Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SORCS2Q96PQ0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SORCS2Q96PQ0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms