Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NLRP3Q96P20 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLRP3Q96P20 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms