Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COG8Q96MW5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COG8Q96MW5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms