Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC7Q96M83 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC7Q96M83 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms