Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00479Q96M42 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00479Q96M42 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00479Q96M42 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms