Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CAPZA3Q96KX2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPZA3Q96KX2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms