Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDLIM2Q96JY6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDLIM2Q96JY6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms