Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
COG3Q96JB2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG3Q96JB2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms