Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LRIG1Q96JA1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms