Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRMT2BQ96GJ1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRMT2BQ96GJ1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms