Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MED8Q96G25 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MED8Q96G25 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms