Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC97Q96F63 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC97Q96F63 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC97Q96F63 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC97Q96F63 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC97Q96F63 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC97Q96F63 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC97Q96F63 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC97Q96F63 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC97Q96F63 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC97Q96F63 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC97Q96F63 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC97Q96F63 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC97Q96F63 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC97Q96F63 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC97Q96F63 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms