Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRP36Q96EU6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RRP36Q96EU6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms