Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MALSU1Q96EH3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms