Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPDL1Q96EA4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms