Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HLA-CQ95604 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-CQ95604 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms