Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TNPO1Q92973 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNPO1Q92973 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms