Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNRQ92752 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNRQ92752 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TNRQ92752 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TNRQ92752 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNRQ92752 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNRQ92752 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNRQ92752 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNRQ92752 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNRQ92752 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNRQ92752 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TNRQ92752 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNRQ92752 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNRQ92752 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNRQ92752 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TNRQ92752 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNRQ92752 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNRQ92752 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TNRQ92752 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNRQ92752 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNRQ92752 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNRQ92752 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNRQ92752 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNRQ92752 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TNRQ92752 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNRQ92752 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNRQ92752 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNRQ92752 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNRQ92752 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNRQ92752 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNRQ92752 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNRQ92752 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNRQ92752 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNRQ92752 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNRQ92752 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNRQ92752 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNRQ92752 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNRQ92752 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TNRQ92752 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNRQ92752 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TNRQ92752 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNRQ92752 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNRQ92752 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNRQ92752 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNRQ92752 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNRQ92752 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNRQ92752 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNRQ92752 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNRQ92752 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNRQ92752 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TNRQ92752 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNRQ92752 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNRQ92752 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNRQ92752 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TNRQ92752 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNRQ92752 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNRQ92752 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNRQ92752 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNRQ92752 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TNRQ92752 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNRQ92752 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNRQ92752 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNRQ92752 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TNRQ92752 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNRQ92752 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNRQ92752 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNRQ92752 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNRQ92752 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TNRQ92752 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNRQ92752 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TNRQ92752 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNRQ92752 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNRQ92752 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNRQ92752 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNRQ92752 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNRQ92752 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNRQ92752 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TNRQ92752 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNRQ92752 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNRQ92752 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNRQ92752 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNRQ92752 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNRQ92752 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNRQ92752 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNRQ92752 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNRQ92752 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNRQ92752 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TNRQ92752 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNRQ92752 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNRQ92752 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNRQ92752 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNRQ92752 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNRQ92752 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNRQ92752 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNRQ92752 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNRQ92752 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNRQ92752 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNRQ92752 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNRQ92752 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TNRQ92752 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms