Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNAAF4Q8WXU2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DNAAF4Q8WXU2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms