Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATRIPQ8WXE1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATRIPQ8WXE1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms