Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF4Q8WV16 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF4Q8WV16 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF4Q8WV16 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF4Q8WV16 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DCAF4Q8WV16 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DCAF4Q8WV16 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCAF4Q8WV16 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms