Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3RF3Q8TEJ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3RF3Q8TEJ3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms