Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSH3Q8TE77 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SSH3Q8TE77 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
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