Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PIK3C3Q8NEB9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PIK3C3Q8NEB9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms