Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC44A5Q8NCS7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A5Q8NCS7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms