Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPC24Q8NBT2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms