Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COLGALT1Q8NBJ5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COLGALT1Q8NBJ5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms