Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME8Q8N427 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME8Q8N427 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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